Что такое клеточные пептиды?

Пептиды, проникающие клетками, представляют собой небольшие пептиды, которые могут легко проникнуть в клеточную мембрану. Этот класс молекул, особенно CPP с целевыми функциями, обещает эффективную доставку лекарств в клетки -мишени.

Следовательно, исследование ИТ имеет определенную биомедицинскую значимость. В этом исследовании CPP с различной трансмембранной активностью были изучены на уровне последовательности, пытаясь выяснить факторы, влияющие на трансмембранную активность CPP, различия последовательностей между CPP с различными видами деятельности и не CPP, и вводят метод для анализа биологических последовательностей.

CPP и последовательности не CPPs были получены из базы данных CPPSITE и различных литературных литератур, а трансмембранные пептиды (HCPPS, MCPPS, LCPP) с высокой, средней и низкой трансмембранной активностью были извлечены из последовательностей CPP для построения наборов данных. Основываясь на этих наборах данных, были проведены следующие исследования:

1, аминокислотный и вторичный структурный состав различных активных CPP и не ППС был проанализирован ANOVA. Было обнаружено, что электростатические и гидрофобные взаимодействия аминокислот сыграли важную роль в трансмембранной активности CPP, а спиральная структура и случайная натулка также влияли на трансмембранную активность CPP.

2. Физические и химические свойства и длина CPP с различными действиями были отображены на двумерной плоскости. Было обнаружено, что CPP и не ППС с различными видами деятельности могут быть сгруппированы под некоторыми особыми свойствами, а HCPP, MCPP, LCPP и не CPP были разделены на три кластера, показывая их различия;

3. В этой статье вводится концепция физической и химической центридности биологической последовательности, и остатки, составляющие последовательность, рассматриваются как точки частиц, а последовательность абстрагируется как система частиц для исследований. Этот метод был применен для анализа CPP, проецируя CPP с различными действиями на 3D -плоскости методом PCA, и было обнаружено, что большинство CPP сгруппировались вместе, а некоторые LCPS сгруппированы вместе с некурсами.

Это исследование имеет значение для проектирования CPP и понимания различий в последовательностях CPP с различными видами деятельности. Кроме того, метод анализа физических и химических центроидов биологических последовательностей, введенных в этой статье, также может быть использован для анализа других биологических проблем. В то же время их можно использовать в качестве входных параметров для некоторых проблем биологической классификации и играть роль в распознавании закономерности.